Nafissatou Diop a une riche carrière professionnelle dans le domaine de la santé mondiale et du développement international. Avant de prendre la Direction générale de l'Association canadienne pour la santé mondiale en janvier 2023, Nafissatou était consultante indépendante. D'aout 2017 à janvier 2022, elle a dirigé avec succès l'Initiative Innovation pour la santé des mères et des enfants d’Afrique (ISMEA), une initiative canadienne phare cofondée par trois agences du gouvernement du Canada. Avant de joindre ISMEA, Nafissatou était la Directrice du bureau de la Population Council au Sénégal. Nafissatou a également occupé des postes à l'Initiative de recherche en santé mondiale, au Centre des programmes de communication de Johns Hopkins, et au Centre d'études et de recherche sur la population pour le développement de l'Institut du Sahel.

En 2018, Nafissatou a été nommée une femme francophone leadeuse en santé mondiale.

Nafissatou est titulaire d'un doctorat en santé publique et d'un certificat en communication pour la santé de l’École d’hygiène et de santé publique de Johns Hopkins (États-Unis), ainsi que d'un diplôme d’ingénieur en informatique (France).